歯ブラシをちゃんとしてても歯の間に虫歯ができているって言われたのですが何故ですか？

虫歯の原因は3つと言われています。細菌（虫歯菌の量と質）・生活習慣（磨き残し、甘いものを食べる頻度と種類、食いしばりなど）・体質（歯の質、唾液の量など）。虫歯予防には、細菌と体質はなかなか変えることはできません。
生活習慣を変えることが大事だと思われます。特に歯の間の虫歯になったのは、この生活習慣のどれかの問題と考えられます。体質や細菌の問題であれば歯の間だけでなく表面なども虫歯になるからです。
特にこういった疑問を持たれる方に多いのが、歯ブラシによる歯みがきを徹底しているけどフロス（糸ようじ）をしていない方です。歯ブラシのみでは歯の間にかなりの割合で磨き残しが見られます。そういった方にはフロスの使用をお勧めします。
欧米では「FLOSS OR DIE」(フロスをするか死ぬか)という言葉があるぐらいですから。
その他の理由も考えられますので、可能であれば歯科医院で診てもらうことが最良です。